Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4F8P98187 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F8P98187 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms