Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBBP68871 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBBP68871 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HBBP68871 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HBBP68871 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HBBP68871 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms