Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A1P68400 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms