Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA1P68133 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms