Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P63132 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms