Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC1P62191 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms