Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-21P61565 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms