Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP6P59044 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NLRP6P59044 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP6P59044 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms