Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FCGRTP55899 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FCGRTP55899 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FCGRTP55899 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FCGRTP55899 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCGRTP55899 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FCGRTP55899 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms