Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC13P55735 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC13P55735 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC13P55735 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC13P55735 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC13P55735 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms