Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKAP1LP55160 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms