Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D1P54289 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms