Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATN1P54259 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATN1P54259 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATN1P54259 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATN1P54259 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATN1P54259 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATN1P54259 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATN1P54259 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATN1P54259 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATN1P54259 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATN1P54259 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms