Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	P53940	YCR050C	YCR050C	309 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	FAD1	YDL045C	921 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	CWC2	YDL209C	1020 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YDR029W	YDR029W	315 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	AHA1	YDR214W	1053 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YGL218W	YGL218W	651 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YOR062C	YOR062C	807 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	CKS1	YBR135W	453 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.27	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	PUS9	YDL036C	1389 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SHE9	YDR393W	1371 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	RRP14	YKL082C	1305 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	KAR5	YMR065W	1515 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YCR085W	YCR085W	354 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	FMP10	YER182W	735 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YLR202C	YLR202C	327 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YLR365W	YLR365W	333 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	URA4	YLR420W	1095 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SPO20	YMR017W	1194 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YPL162C	YPL162C	822 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MET16	YPR167C	786 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	BCH2	YKR027W	2298 nt		3.26	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	RRI1	YDL216C	1323 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	LOS1	YKL205W	3303 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SOF1	YLL011W	1470 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	HMRA1	YCR097W	381 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	NUS1	YDL193W	1128 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	CNN1	YFR046C	1086 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	BAT2	YJR148W	1131 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	PAM18	YLR008C	507 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SNO1	YMR095C	675 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YMR178W	YMR178W	825 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YBR134W	YBR134W	402 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	UGA3	YDL170W	1587 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	PTM1	YKL039W	1572 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	LTV1	YKL143W	1392 nt		3.25	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YCR100C	YCR100C	951 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	RMD1	YDL001W	1293 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YDR249C	YDR249C	1122 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	LST7	YGR057C	729 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	VMA22	YHR060W	546 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YAE1	YJR067C	426 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SYF1	YDR416W	2580 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YPK3	YBR028C	1578 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YOL075C	YOL075C	3885 nt		3.24	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	BUD26	YDR241W	288 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YFL012W	YFL012W	447 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	ERG25	YGR060W	930 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SPT4	YGR063C	309 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	HIS5	YIL116W	1158 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	ERG20	YJL167W	1059 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	BNA1	YJR025C	534 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MSN4	YKL062W	1893 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	TFA2	YKR062W	987 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	IBD2	YNL164C	1056 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MED7	YOL135C	669 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SRL4	YPL033C	846 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.23	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	PRM2	YIL037C	1971 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SIR1	YKR101W	1965 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MAG1	YER142C	891 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YGR079W	YGR079W	1113 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	GEP4	YHR100C	558 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	EST3	YIL009C-A	546 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	CAP2	YIL034C	864 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	RPS31	YLR167W	459 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YLR271W	YLR271W	825 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	MCM1	YMR043W	861 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	INA17	YPL099C	549 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	ECM8	YBR076W	1065 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	CBP6	YBR120C	489 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	PBP2	YBR233W	1242 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	KIN4	YOR233W	2403 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	SWP82	YFL049W	1872 nt		3.22	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	YBR225W	YBR225W	2703 nt		3.21	□□□□□ -1.89
APJ1	P53940	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.21	□□□□□ -1.9

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