Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms