Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOSBP53539 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOSBP53539 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSBP53539 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSBP53539 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSBP53539 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSBP53539 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms