Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A2P52657 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms