Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBP50607 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBP50607 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBP50607 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBP50607 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBP50607 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBP50607 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBP50607 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBP50607 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBP50607 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBP50607 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBP50607 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBP50607 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBP50607 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBP50607 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBP50607 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBP50607 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBP50607 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBP50607 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBP50607 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBP50607 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms