Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms