Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms