Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTBP49356 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTBP49356 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTBP49356 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTBP49356 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTBP49356 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTBP49356 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTBP49356 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTBP49356 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTBP49356 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTBP49356 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTBP49356 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTBP49356 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms