Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI2P48788 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms