Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms