Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A9P48067 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms