Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A4P43007 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms