Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMPOP42166 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMPOP42166 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPOP42166 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TMPOP42166 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMPOP42166 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPOP42166 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMPOP42166 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMPOP42166 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms