Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBRP36941 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBRP36941 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBRP36941 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBRP36941 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms