Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX11P35716 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX11P35716 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX11P35716 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX11P35716 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX11P35716 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX11P35716 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX11P35716 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX11P35716 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX11P35716 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX11P35716 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms