Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYKP34925 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYKP34925 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYKP34925 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYKP34925 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYKP34925 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYKP34925 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYKP34925 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RYKP34925 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYKP34925 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYKP34925 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYKP34925 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RYKP34925 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RYKP34925 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYKP34925 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms