Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H1P32780 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H1P32780 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms