Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFNP31947 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFNP31947 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFNP31947 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFNP31947 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFNP31947 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFNP31947 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFNP31947 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms