Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLIP1P30622 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms