Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms