Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP1P29466 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP1P29466 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP1P29466 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP1P29466 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP1P29466 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP1P29466 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP1P29466 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP1P29466 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms