Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD34P28906 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD34P28906 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD34P28906 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD34P28906 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CD34P28906 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD34P28906 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD34P28906 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD34P28906 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD34P28906 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms