Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBL1P28749 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms