Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms