Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5F1P24539 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5F1P24539 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5F1P24539 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5F1P24539 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms