Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4BP23588 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms