Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms