Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCP20941 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCP20941 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCP20941 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCP20941 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCP20941 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCP20941 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCP20941 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCP20941 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCP20941 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCP20941 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCP20941 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCP20941 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCP20941 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCP20941 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms