Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF3P20783 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms