Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP4AP20648 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms