Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD58P19256 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD58P19256 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD58P19256 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD58P19256 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD58P19256 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD58P19256 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD58P19256 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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