Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN8P19075 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms