Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN1P18031 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms