Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZKSCAN1P17029 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZKSCAN1P17029 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZKSCAN1P17029 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZKSCAN1P17029 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZKSCAN1P17029 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZKSCAN1P17029 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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