Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-EP13747 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms