Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms