Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RARBP10826 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARBP10826 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARBP10826 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RARBP10826 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARBP10826 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARBP10826 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARBP10826 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARBP10826 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARBP10826 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms